El Máster en Pesca y Protección de Aguas, un programa de estudios completo y versátil, explora los aspectos biológicos, ecológicos y tecnológicos de la pesca y la gestión del agua, así como las cuestiones relacionadas con la protección del medio acuático. Además, el programa también ofrece una visión de diversos campos relacionados.

El programa de maestría en Química de Polímero en el JKU Linz es un programa integral de postgrado.

El programa de maestría en Economía es un programa académico y científico integral de nivel avanzado. El programa prepara a los estudiantes para emprender tareas desafiantes en instituciones de política económica en Austria y en el extranjero, en empresas privadas, oficinas de la administración pública, o seguir una carrera académica en institutos de investigación, o en investigación comercial.

El programa conjunto de maestría en "Química Biológica" es un programa único ofrecido por la Universidad Johannes Kepler y la Universidad de Bohemia del Sur (USB) en Budweis (České Budějovice).

Versátil y orientado al futuro, el programa de maestría prepara a los estudiantes para ejercer profesiones interesantes en la investigación farmacéutica, la investigación biomédica, la genética, las biotecnologías, el análisis de datos y el desarrollo de software.

El programa de maestría en Gestión

El Máster en Biología Molecular es un programa interdisciplinario conjunto ofrecido por JKU Linz y la Universidad de Salzburgo.